42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1544 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 201 aa  418  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000461965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  26.88 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.23 
 
 		 364 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0520  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  30.92 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.701986  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0512  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.81 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00341005  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.75 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  30.56 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.29 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  41.38 
 
 		 512 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.11 
 
 		 435 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.16 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  26.11 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 		 130 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.75 
 
 		 381 aa  44.7  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 526 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.78 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.63 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.86 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  27.33 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.14 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  25.15 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.21 
 
 		 370 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  45.83 
 
 		 159 aa  43.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  31.37 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  25.85 
 
 		 369 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40.91 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 		 372 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  35.85 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  30.77 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  26.15 
 
 		 354 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.18 
 
 		 233 aa  42.4  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.33 
 
 		 141 aa  42  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.41 
 
 		 171 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  36.11 
 
 		 141 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2712  Rieske (2Fe-2S) region  32.67 
 
 		 206 aa  42  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  25.38 
 
 		 440 aa  42  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.33 
 
 		 210 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.23 
 
 		 324 aa  42  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  33.82 
 
 		 148 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.67 
 
 		 360 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  34.78 
 
 		 365 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>