59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0470 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
324 aa  667    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  73.1 
 
 
361 aa  504  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  61.8 
 
 
322 aa  331  1e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  60.75 
 
 
326 aa  322  6e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50.46 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.07 
 
 
260 aa  191  1e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  32.72 
 
 
242 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.63 
 
 
238 aa  87  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.48 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.23 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.26 
 
 
241 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  25.7 
 
 
175 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.87 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.15 
 
 
338 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.72 
 
 
399 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 
360 aa  53.1  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.07 
 
 
210 aa  52.4  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3539  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.36 
 
 
206 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  26.64 
 
 
369 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.87 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.29 
 
 
355 aa  50.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  25.19 
 
 
345 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.22 
 
 
356 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  27.78 
 
 
205 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3650  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.32 
 
 
206 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376708  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3707  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.32 
 
 
206 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2748  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.32 
 
 
206 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1805  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.32 
 
 
206 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3256  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.32 
 
 
206 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2698  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.32 
 
 
206 aa  49.3  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3676  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.32 
 
 
206 aa  49.3  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0441  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.36 
 
 
206 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2666  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.36 
 
 
206 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.505279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0420  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.36 
 
 
206 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000059328 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2743  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  22.63 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543941  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0344  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.87 
 
 
206 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  28.1 
 
 
168 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  24.88 
 
 
220 aa  47.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
300 aa  47.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.76 
 
 
349 aa  47.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.02 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  24.88 
 
 
181 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2977  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25.26 
 
 
206 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  27.05 
 
 
182 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  31.13 
 
 
365 aa  46.6  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3544  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  23.96 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.576604  normal  0.0132387 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  31.58 
 
 
187 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  29.75 
 
 
203 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.04 
 
 
199 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  27.75 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  35.71 
 
 
192 aa  44.3  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  25.83 
 
 
168 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0414  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron- sulfur subunit  23.16 
 
 
206 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  24.76 
 
 
181 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.23 
 
 
206 aa  42.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  23.75 
 
 
346 aa  42.7  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  22.6 
 
 
359 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  32.93 
 
 
159 aa  42.7  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3500  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  23.16 
 
 
198 aa  42.7  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.464375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>