81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1251 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 		 187 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0943  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  46.81 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.218843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.25 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2067  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.64 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.767488 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  34.09 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  33.06 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  32.2 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.91 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  34.95 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  30.88 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  37.5 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.21 
 
 		 359 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  35.38 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.96 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.24 
 
 		 300 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  33.33 
 
 		 315 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33 
 
 		 370 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.66 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  32.94 
 
 		 354 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.47 
 
 		 349 aa  52  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.24 
 
 		 349 aa  51.6  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.09 
 
 		 372 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.64 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.18 
 
 		 364 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  33.64 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  28.7 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  28.7 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.47 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  27.03 
 
 		 369 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 		 130 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  30.48 
 
 		 392 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.13 
 
 		 338 aa  48.9  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  39.71 
 
 		 345 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.21 
 
 		 330 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.91 
 
 		 135 aa  48.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.48 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.99 
 
 		 370 aa  47.8  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.03 
 
 		 130 aa  47.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 		 441 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  39.33 
 
 		 365 aa  47.8  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.06 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  32.89 
 
 		 346 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.21 
 
 		 260 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 		 356 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.56 
 
 		 360 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.31 
 
 		 130 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.14 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  35.06 
 
 		 160 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.24 
 
 		 356 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.04 
 
 		 361 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.82 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.56 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000461965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  30.34 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.06 
 
 		 130 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.1 
 
 		 399 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  30.77 
 
 		 173 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.29 
 
 		 343 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.58 
 
 		 374 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.98 
 
 		 148 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.36 
 
 		 382 aa  45.1  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.9 
 
 		 151 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.3 
 
 		 326 aa  44.7  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  36.76 
 
 		 358 aa  44.3  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  24.48 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 		 640 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 368 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.67 
 
 		 435 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.09 
 
 		 324 aa  43.9  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.37 
 
 		 138 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.5 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  28.57 
 
 		 429 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.24 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.76 
 
 		 355 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.23 
 
 		 179 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  35.8 
 
 		 207 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.44 
 
 		 361 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  37.18 
 
 		 148 aa  41.6  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0118  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  25.42 
 
 		 166 aa  41.2  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.15 
 
 		 361 aa  41.2  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  35.44 
 
 		 131 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>