81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3949 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  100 
 
 		 173 aa  351  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  76.3 
 
 		 173 aa  261  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  38.37 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  44.53 
 
 		 168 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  38.89 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  40.74 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  40.72 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  42.19 
 
 		 205 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.09 
 
 		 199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.16 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.68 
 
 		 370 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 		 360 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  40.91 
 
 		 315 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  39.13 
 
 		 440 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  39.71 
 
 		 365 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.96 
 
 		 300 aa  52  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 		 203 aa  51.6  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.19 
 
 		 349 aa  51.6  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  36.99 
 
 		 354 aa  51.2  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  37.31 
 
 		 349 aa  50.8  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 514 aa  51.2  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.85 
 
 		 359 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 		 364 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.66 
 
 		 326 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.17 
 
 		 374 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.81 
 
 		 368 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.82 
 
 		 338 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  35.37 
 
 		 345 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 		 441 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.19 
 
 		 330 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.88 
 
 		 372 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.88 
 
 		 356 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.42 
 
 		 253 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.75 
 
 		 272 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.04 
 
 		 252 aa  48.9  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  36.36 
 
 		 369 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1751  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  38.71 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.66 
 
 		 343 aa  47.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 		 356 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  35.82 
 
 		 358 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.36 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  35.29 
 
 		 399 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  35.82 
 
 		 346 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  35.71 
 
 		 429 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  30.77 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.2 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.35 
 
 		 260 aa  45.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.85 
 
 		 355 aa  45.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 508 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.82 
 
 		 370 aa  45.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.34 
 
 		 594 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.29 
 
 		 399 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.04 
 
 		 233 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.29 
 
 		 361 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.51 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 		 122 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  32.86 
 
 		 414 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.29 
 
 		 382 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.86 
 
 		 414 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 		 402 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.86 
 
 		 414 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.29 
 
 		 406 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.29 
 
 		 593 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.38 
 
 		 361 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  30.39 
 
 		 392 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  30.88 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.65 
 
 		 361 aa  43.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  27.89 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.31 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  22.58 
 
 		 324 aa  42.4  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 		 516 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  40.68 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  35.23 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 506 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  24.66 
 
 		 322 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  28.97 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 		 239 aa  42  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  27.5 
 
 		 159 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.79 
 
 		 135 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 381 aa  40.8  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0977  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.87 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>