153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1890 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
355 aa  722    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  61.54 
 
 
338 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  64.49 
 
 
349 aa  421  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  61.7 
 
 
345 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.67 
 
 
349 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  60.12 
 
 
356 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  58.93 
 
 
356 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  56.59 
 
 
346 aa  373  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.73 
 
 
343 aa  346  4e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  54.23 
 
 
358 aa  345  8e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  50.75 
 
 
354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.54 
 
 
359 aa  301  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.4 
 
 
368 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  45.81 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.14 
 
 
360 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.27 
 
 
372 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.9 
 
 
441 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.21 
 
 
330 aa  219  5e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  43.22 
 
 
440 aa  219  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.06 
 
 
399 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  39.68 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.42 
 
 
364 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  35.56 
 
 
382 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  42.91 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.62 
 
 
370 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.9 
 
 
361 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.69 
 
 
374 aa  179  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.94 
 
 
361 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.34 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  34.3 
 
 
414 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.3 
 
 
414 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.3 
 
 
414 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.24 
 
 
402 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  31.76 
 
 
429 aa  166  8e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  34.52 
 
 
392 aa  165  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.42 
 
 
370 aa  159  9e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.12 
 
 
399 aa  152  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.57 
 
 
233 aa  93.6  5e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
215 aa  86.7  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.57 
 
 
199 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  47.57 
 
 
192 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  38.57 
 
 
207 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.51 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  27.6 
 
 
210 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  33.76 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.6 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  37.63 
 
 
203 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  44.16 
 
 
206 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  48.39 
 
 
141 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.78 
 
 
179 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  48.33 
 
 
159 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.62 
 
 
239 aa  56.6  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  42.42 
 
 
168 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  48.15 
 
 
205 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45 
 
 
435 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  43.08 
 
 
175 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.91 
 
 
151 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  46.3 
 
 
168 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  39.29 
 
 
149 aa  54.3  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52.83 
 
 
269 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46657  predicted protein  34.65 
 
 
217 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.79 
 
 
130 aa  53.1  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.69 
 
 
178 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 
159 aa  52.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.4 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  43.1 
 
 
63 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  24.22 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.95 
 
 
178 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.62 
 
 
186 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
639 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4136  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.9 
 
 
167 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06651  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  35 
 
 
178 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1794  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.35 
 
 
178 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  40.91 
 
 
160 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.76 
 
 
141 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05181  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32 
 
 
178 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05171  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.35 
 
 
178 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.900646  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0462  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32 
 
 
178 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  44.29 
 
 
148 aa  50.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2121  twin-arginine translocation pathway signal  39.71 
 
 
172 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.85037  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.38 
 
 
139 aa  49.7  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  23.89 
 
 
324 aa  48.9  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04871  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32 
 
 
178 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.38 
 
 
146 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1396  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  24.87 
 
 
188 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.95537  normal  0.23919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  44.26 
 
 
645 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  39.34 
 
 
139 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  38.33 
 
 
139 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3894  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.84 
 
 
175 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.75 
 
 
161 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.46 
 
 
644 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.46 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  28.91 
 
 
165 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.03 
 
 
178 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.06 
 
 
134 aa  47.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.94 
 
 
253 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04631  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  33 
 
 
178 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  38.98 
 
 
163 aa  47.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.8 
 
 
640 aa  47.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>