147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4950 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  38.17 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  38.2 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  41.78 
 
 
207 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  38.1 
 
 
206 aa  102  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.9 
 
 
356 aa  94.7  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  39.11 
 
 
354 aa  92  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.64 
 
 
359 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.85 
 
 
356 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.68 
 
 
349 aa  88.2  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.97 
 
 
349 aa  88.2  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  35.76 
 
 
345 aa  86.7  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.81 
 
 
330 aa  85.9  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.52 
 
 
343 aa  85.1  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.1 
 
 
338 aa  84.7  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.16 
 
 
368 aa  84.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  31.82 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  31.22 
 
 
346 aa  84  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.67 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.57 
 
 
355 aa  82  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  39.47 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.58 
 
 
360 aa  78.2  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.53 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  32.46 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  38.38 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.59 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.42 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  31.43 
 
 
358 aa  72  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  34.01 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3057  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.84 
 
 
382 aa  68.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.546534  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.61 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  49.35 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  31.79 
 
 
392 aa  65.9  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3559  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
402 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892758  normal  0.0992213 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.76 
 
 
364 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3293  Rieske (2Fe-2S) region  33.96 
 
 
414 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 
414 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142183  normal  0.0379224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3304  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 
414 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318703  normal  0.260108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  34.29 
 
 
429 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2954  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.38 
 
 
406 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62346  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2694  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.91 
 
 
399 aa  61.6  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.415104  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  31.87 
 
 
141 aa  61.2  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1650  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  43.06 
 
 
139 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.88 
 
 
370 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  47.54 
 
 
149 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.22 
 
 
361 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.03 
 
 
370 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.22 
 
 
361 aa  60.5  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.97 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.58 
 
 
215 aa  59.7  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.9 
 
 
374 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
159 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.42 
 
 
151 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.58 
 
 
159 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  42.11 
 
 
159 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  48.44 
 
 
152 aa  54.7  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  39.53 
 
 
163 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  46.55 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.75 
 
 
122 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  46.43 
 
 
205 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.44 
 
 
179 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.86 
 
 
146 aa  52  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5928  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 
220 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.79 
 
 
136 aa  51.2  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 
516 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  49.02 
 
 
168 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2712  Rieske (2Fe-2S) region  29.76 
 
 
206 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.15 
 
 
381 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1913  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
184 aa  50.4  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.18 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000504338  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.83 
 
 
130 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  32.2 
 
 
175 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.19 
 
 
161 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1922  Rieske (2Fe-2S) region  34.85 
 
 
139 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00607614  normal  0.581451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  36.23 
 
 
160 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.75 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.25 
 
 
640 aa  48.5  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
139 aa  48.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.33 
 
 
644 aa  48.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2379  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.39 
 
 
139 aa  48.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000276533  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.94 
 
 
155 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  40.68 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  37.11 
 
 
131 aa  47.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.55 
 
 
141 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.48 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 
171 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0582  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.55 
 
 
269 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.51 
 
 
148 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.62 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
253 aa  46.6  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.67 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1419  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  37.88 
 
 
179 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000338056  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  51.11 
 
 
134 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49.02 
 
 
130 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1088  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  39.39 
 
 
63 aa  46.6  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2067  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.87 
 
 
145 aa  45.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.767488 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1734  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  38.1 
 
 
178 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.847786  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
526 aa  45.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1208  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
177 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  37.93 
 
 
168 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>