51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0288 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  746    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  73.1 
 
 		 324 aa  486  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  57.36 
 
 		 322 aa  302  7.000000000000001e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.9 
 
 		 326 aa  295  9e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.89 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.16 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.19 
 
 		 272 aa  94  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  32.55 
 
 		 242 aa  93.6  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.48 
 
 		 238 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.81 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.39 
 
 		 241 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  27.93 
 
 		 175 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.44 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.57 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.52 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  33.64 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  29.63 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.65 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.56 
 
 		 356 aa  53.5  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  28.7 
 
 		 168 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  26.41 
 
 		 345 aa  53.1  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.4 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  28 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.25 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.8 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  30.84 
 
 		 168 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.39 
 
 		 199 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.67 
 
 		 372 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  32.97 
 
 		 210 aa  50.1  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  32.32 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  32.35 
 
 		 192 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  36.04 
 
 		 187 aa  46.6  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3256  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.27 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3676  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.27 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 		 159 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2698  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.27 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1805  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.27 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3650  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.27 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376708  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3707  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.27 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2748  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.27 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2743  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.98 
 
 		 205 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0344  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.98 
 
 		 206 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.52 
 
 		 130 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  28.33 
 
 		 203 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3539  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.98 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  30.61 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  26.05 
 
 		 220 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0420  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.46 
 
 		 206 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000059328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0441  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.46 
 
 		 206 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2666  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.46 
 
 		 206 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.505279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>