79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1938 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
260 aa  524  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  72.4 
 
 
253 aa  307  9e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  50.41 
 
 
322 aa  236  4e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.66 
 
 
326 aa  229  4e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.441209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  51.15 
 
 
324 aa  211  7e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.89 
 
 
361 aa  203  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.81 
 
 
238 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.86 
 
 
252 aa  104  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.58 
 
 
272 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
241 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  38.24 
 
 
242 aa  99.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  29.67 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  33.94 
 
 
175 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  33.98 
 
 
168 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.47 
 
 
355 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.38 
 
 
349 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.57 
 
 
338 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.64 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.4 
 
 
372 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  26.86 
 
 
345 aa  53.9  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.89 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.835354 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  30.41 
 
 
210 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2113  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.34 
 
 
219 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  29.45 
 
 
354 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  32.71 
 
 
165 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.7 
 
 
233 aa  52.8  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.639191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.19 
 
 
349 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3936  hypothetical protein  41.67 
 
 
192 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.827287  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.73 
 
 
360 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.29 
 
 
330 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  36 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  31.2 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  26.2 
 
 
369 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.31 
 
 
364 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  30.52 
 
 
187 aa  50.1  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  25.36 
 
 
168 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  36.25 
 
 
365 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.32 
 
 
399 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  27.22 
 
 
346 aa  48.9  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.35 
 
 
370 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.14 
 
 
359 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  25 
 
 
181 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.44 
 
 
130 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0318  Rieske (2Fe-2S) region  30 
 
 
220 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.711833  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0364  Rieske iron-sulfur protein  23.72 
 
 
207 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
368 aa  45.8  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3256  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25.41 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2698  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25.41 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1805  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25.41 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3650  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25.41 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376708  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3676  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25.41 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3707  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25.41 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2748  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25.41 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  26.78 
 
 
182 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3950  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  28.57 
 
 
180 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.63 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.75 
 
 
356 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  33.8 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  32.88 
 
 
149 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  25.13 
 
 
181 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2977  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  24.86 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1958  cytochrome b6/f complex Fe-S subunit  28.72 
 
 
179 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  26.84 
 
 
182 aa  43.9  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  26.4 
 
 
181 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.33 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000461965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4950  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.33 
 
 
199 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.967902  normal  0.821565 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0021  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.53 
 
 
209 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.581068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.51 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0385  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  29.26 
 
 
179 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0420  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000059328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0441  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2666  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  25 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.505279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  25.23 
 
 
178 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  26.44 
 
 
358 aa  42.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0628  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  31.89 
 
 
178 aa  42.7  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.448712  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0244  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.86 
 
 
214 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0344  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  24.44 
 
 
206 aa  42  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1353  FAD dependent oxidoreductase  36.14 
 
 
504 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>