56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0501 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  656    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.441209 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  70.5 
 
 		 322 aa  440  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0470  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  60.75 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0288  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.9 
 
 		 361 aa  303  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.37556  normal  0.576557 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  54.63 
 
 		 253 aa  226  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  53.1 
 
 		 260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.48 
 
 		 241 aa  106  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.62 
 
 		 238 aa  95.9  8e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  33.04 
 
 		 242 aa  95.9  8e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.83 
 
 		 252 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.45 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 175 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.75 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3539  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  29.44 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0344  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  29.95 
 
 		 206 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0420  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.93 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000059328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2666  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.93 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.505279  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0441  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  28.93 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  28.32 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1805  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.92 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.440597  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  27.43 
 
 		 168 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2748  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.92 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3707  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.92 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3650  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.92 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376708  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2698  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.92 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.839237  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3256  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.92 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3676  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.92 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.26 
 
 		 399 aa  53.1  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2977  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.32 
 
 		 206 aa  51.6  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216315  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2743  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.23 
 
 		 205 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.56 
 
 		 349 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0414  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron- sulfur subunit  27.55 
 
 		 206 aa  50.1  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.63 
 
 		 130 aa  49.7  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1693  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  26.44 
 
 		 177 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132079 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  23.88 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3544  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  26.53 
 
 		 206 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.576604  normal  0.0132387 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.96 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.46 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0471  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  28.3 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  25 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0368  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.64 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0359  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  27.64 
 
 		 206 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  31.11 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.17 
 
 		 435 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  31.07 
 
 		 365 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  26.37 
 
 		 369 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33 
 
 		 372 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  26.01 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  25.52 
 
 		 178 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  31.3 
 
 		 187 aa  44.3  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.07 
 
 		 356 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.89 
 
 		 349 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.1 
 
 		 199 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0844  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.03 
 
 		 195 aa  43.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  26.79 
 
 		 168 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.12 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>