70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4426 on replicon NC_007960
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007960  Nham_4426  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3949  arsenite oxidase small subunit  76.3 
 
 		 173 aa  246  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  40.72 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5703  arsenite oxidase, small subunit  41.01 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3085  twin-arginine translocation pathway signal  40.46 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0378  arsenite oxidase, small subunit  39.16 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0861749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5679  arsenite oxidase, small subunit  39.57 
 
 		 205 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0383  arsenite oxidase, small subunit  39.63 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293827  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1370  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.09 
 
 		 199 aa  101  5e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.571806 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.56 
 
 		 300 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 		 435 aa  53.9  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1251  Rieske (2Fe-2S) region  35.38 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.573728  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.13 
 
 		 370 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1375  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 		 374 aa  51.2  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.618481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.71 
 
 		 360 aa  51.2  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.582599 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2077  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.71 
 
 		 349 aa  50.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2604  Rieske (2Fe-2S) region  30.95 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455054  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2010  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.19 
 
 		 349 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1911  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.22 
 
 		 253 aa  50.4  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.518415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2490  Rieske (2Fe-2S) protein  30.94 
 
 		 315 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.267078  normal  0.625533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1751  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.32 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 		 149 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15690  Rieske Fe-S protein  37.8 
 
 		 345 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0501  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.2 
 
 		 326 aa  49.7  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.441209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1448  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.81 
 
 		 338 aa  49.7  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.12182  normal  0.124456 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2537  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.43 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14170  Rieske Fe-S protein  36.99 
 
 		 354 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1020  ubiquinol-cytochrome c reductase iron-sulfur subunit  38.24 
 
 		 365 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00851042  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.85 
 
 		 233 aa  48.5  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.639191 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0763  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.19 
 
 		 252 aa  48.5  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0211389  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3061  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.39 
 
 		 372 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00591656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2869  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.6 
 
 		 241 aa  48.5  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3106  Rieske (2Fe-2S) protein  37.68 
 
 		 440 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.123107  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.81 
 
 		 368 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.19 
 
 		 330 aa  48.5  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0728361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4118  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.76 
 
 		 364 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.86033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.16 
 
 		 594 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0322  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.1 
 
 		 272 aa  47.8  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.3 
 
 		 171 aa  47.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1679  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.85 
 
 		 359 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0520  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.2 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0871282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2675  Rieske Fe-S protein-like protein  37.88 
 
 		 369 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1811  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.23 
 
 		 441 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.491365  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1890  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.76 
 
 		 355 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.199265  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3252  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.11 
 
 		 343 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0766211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2211  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 		 356 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0877373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3133  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  36.76 
 
 		 399 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1948  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 		 356 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16200  Rieske Fe-S protein  35.82 
 
 		 346 aa  45.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.434497  normal  0.691399 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3250  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.76 
 
 		 370 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00634277  hitchhiker  0.0000373307 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0250  FAD dependent oxidoreductase  38.89 
 
 		 516 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 508 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0423  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.29 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  32.65 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.34 
 
 		 593 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1184  FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 		 514 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10690  Rieske Fe-S protein  31.37 
 
 		 392 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0599647  normal  0.601258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0620  Rieske iron-sulfur protein SoxL2  24.66 
 
 		 322 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.98 
 
 		 122 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12140  Rieske Fe-S protein  32.35 
 
 		 358 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.315272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29 
 
 		 361 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1938  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.15 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.144027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  40.68 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 526 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2006  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 524 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  39.29 
 
 		 517 aa  42.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3293  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.81 
 
 		 361 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  0.272111 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2768  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 506 aa  41.2  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.290252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1558  hypothetical protein  28.26 
 
 		 242 aa  40.8  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12223  Rieske iron-sulfur protein qcrA  31.43 
 
 		 429 aa  40.8  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>