47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4545 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  400  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  89.6 
 
 
218 aa  359  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  36.28 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  41.12 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  37.38 
 
 
142 aa  74.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  39.25 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  37.84 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  37.61 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  36.94 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  37.84 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  39.25 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  36.04 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  36.04 
 
 
134 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  36.04 
 
 
146 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  39.29 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  39.29 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  39.29 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  39.29 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  39.29 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  39.29 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  36.94 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  32.46 
 
 
155 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  32.76 
 
 
141 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  34.23 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  30.25 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  32.71 
 
 
124 aa  55.1  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  33.62 
 
 
148 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  30.39 
 
 
165 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  34.69 
 
 
145 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  27.27 
 
 
149 aa  48.9  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  30.43 
 
 
149 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  33.67 
 
 
145 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  35.9 
 
 
294 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  29.46 
 
 
158 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  25.32 
 
 
158 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  31.3 
 
 
141 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2364  arsenite oxidase, small subunit  30 
 
 
165 aa  43.9  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  29.09 
 
 
145 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  30.51 
 
 
167 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  24.78 
 
 
174 aa  43.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  31.68 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>