56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2093 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  293  8e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  56.59 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5334  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  52.31 
 
 		 294 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  51.32 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  51.32 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  51.32 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  47.52 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  45.64 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  45.7 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  45.27 
 
 		 145 aa  120  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  49.59 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4980  hypothetical protein  44.44 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3840  hypothetical protein  48.09 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.906817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3996  hypothetical protein  48.23 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  43.05 
 
 		 141 aa  116  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  41.61 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0813  hypothetical protein  51.85 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  48.09 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0924  hypothetical protein  44.29 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  44.8 
 
 		 141 aa  113  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  46.34 
 
 		 194 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  48 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  43.75 
 
 		 202 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  42.18 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0468  hypothetical protein  45.04 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  43.15 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0309  hypothetical protein  40.25 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0622051 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  45.26 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  45.26 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  43.8 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  44.53 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  45.26 
 
 		 134 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  43.8 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  39.07 
 
 		 142 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  38.61 
 
 		 158 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  41.27 
 
 		 158 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  40.54 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  44.52 
 
 		 133 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  44.92 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  46.38 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  45.83 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  44.54 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  44.54 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  44.54 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  44.54 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  44.54 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  44.54 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1386  hypothetical protein  36.29 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000107026  normal  0.0105588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  41.8 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3286  hypothetical protein  36.97 
 
 		 277 aa  80.5  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  47.47 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  38.98 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  34.65 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  33.62 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>