56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1135 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  277  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  277  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  277  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  277  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  277  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  277  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  77.04 
 
 
149 aa  216  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  77.78 
 
 
134 aa  215  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  77.04 
 
 
134 aa  214  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  76.3 
 
 
146 aa  214  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  76.3 
 
 
134 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  75.56 
 
 
134 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  85.19 
 
 
135 aa  205  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  72.59 
 
 
134 aa  201  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  66.67 
 
 
133 aa  176  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  64.44 
 
 
133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  67.41 
 
 
133 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  62.07 
 
 
133 aa  155  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  60.32 
 
 
133 aa  150  5.9999999999999996e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  58.33 
 
 
142 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  47.37 
 
 
141 aa  120  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  44.87 
 
 
158 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  46.67 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0309  hypothetical protein  47.83 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0622051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  47.83 
 
 
158 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  46.38 
 
 
145 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  43.8 
 
 
145 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  46.03 
 
 
149 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  47.69 
 
 
145 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  47.69 
 
 
145 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  47.69 
 
 
145 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  45.16 
 
 
174 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  47.11 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  43.17 
 
 
149 aa  97.1  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  46.61 
 
 
165 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  41.22 
 
 
155 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  43.1 
 
 
194 aa  90.9  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  39.84 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  44.54 
 
 
148 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  39.29 
 
 
202 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0813  hypothetical protein  43.61 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4980  hypothetical protein  42.48 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  38.46 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  41.88 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3996  hypothetical protein  41.8 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  40.98 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  36.51 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  43.52 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0468  hypothetical protein  36.76 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0924  hypothetical protein  38.3 
 
 
142 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5334  hypothetical protein  40.17 
 
 
297 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418335  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3840  hypothetical protein  40.32 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.906817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  33.82 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3286  hypothetical protein  34.17 
 
 
277 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  39.29 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1386  hypothetical protein  36 
 
 
268 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000107026  normal  0.0105588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>