56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2123 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  65.38 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  54.4 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  48 
 
 		 202 aa  130  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  52.42 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  52.21 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  52.21 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  52.21 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  49.64 
 
 		 141 aa  124  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  46.9 
 
 		 141 aa  122  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5334  hypothetical protein  45.21 
 
 		 297 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  54.87 
 
 		 294 aa  117  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0309  hypothetical protein  49.6 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0622051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  50 
 
 		 148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0468  hypothetical protein  49.17 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4980  hypothetical protein  50.39 
 
 		 146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  47.2 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  48 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  53.1 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3996  hypothetical protein  53.1 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0924  hypothetical protein  50.43 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  46.4 
 
 		 158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  47.5 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  41.03 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  44.22 
 
 		 141 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3840  hypothetical protein  55.34 
 
 		 142 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.906817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  45.97 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  42.97 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  48.57 
 
 		 146 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  48.57 
 
 		 134 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  43.8 
 
 		 149 aa  105  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  47.62 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  47.62 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  47.62 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  46.67 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  47.75 
 
 		 135 aa  99.4  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  45.54 
 
 		 134 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  48.18 
 
 		 133 aa  97.8  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  47.75 
 
 		 135 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  47.75 
 
 		 135 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  47.75 
 
 		 135 aa  97.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  47.75 
 
 		 135 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  47.75 
 
 		 135 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  47.75 
 
 		 135 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  49.06 
 
 		 133 aa  97.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  49.07 
 
 		 133 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  43.52 
 
 		 142 aa  95.5  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  46.15 
 
 		 133 aa  95.5  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  42.73 
 
 		 133 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0813  hypothetical protein  45.45 
 
 		 147 aa  92  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1386  hypothetical protein  37.3 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000107026  normal  0.0105588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3286  hypothetical protein  34.75 
 
 		 277 aa  78.6  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  38.74 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  26.09 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  25.66 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>