51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2585 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  437  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  89.6 
 
 
202 aa  359  2e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  38.6 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  42.73 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  41.44 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  41.44 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  40.54 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  42.99 
 
 
133 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  41.12 
 
 
134 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  41.12 
 
 
134 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  39.45 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  40.19 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  40.19 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  38.32 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  41.96 
 
 
135 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  41.96 
 
 
135 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  41.96 
 
 
135 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  41.96 
 
 
135 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  41.96 
 
 
135 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  41.96 
 
 
135 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  41.12 
 
 
134 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  39.81 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  35.04 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  34.21 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  35.71 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  32.46 
 
 
202 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  34.65 
 
 
148 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  35.96 
 
 
145 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  36.44 
 
 
145 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  32.35 
 
 
165 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  30.28 
 
 
124 aa  54.7  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  35.59 
 
 
145 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  35.59 
 
 
145 aa  53.1  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  35.59 
 
 
145 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  28.23 
 
 
149 aa  52.4  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  31.3 
 
 
149 aa  52.4  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  31.25 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  31.58 
 
 
141 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  30.91 
 
 
145 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  30.36 
 
 
158 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  27.11 
 
 
158 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4980  hypothetical protein  29.2 
 
 
146 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0309  hypothetical protein  29.84 
 
 
158 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0622051 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  32.35 
 
 
144 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  31.62 
 
 
141 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  29.63 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1386  hypothetical protein  28.07 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000107026  normal  0.0105588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0468  hypothetical protein  30.77 
 
 
168 aa  42.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  25.44 
 
 
174 aa  42  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  30.77 
 
 
167 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3996  hypothetical protein  32.97 
 
 
144 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>