58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0923 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 141 aa  290  6e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  70.21 
 
 		 141 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  71.63 
 
 		 167 aa  201  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0468  hypothetical protein  80.17 
 
 		 168 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0924  hypothetical protein  59.15 
 
 		 142 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3840  hypothetical protein  54.23 
 
 		 142 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.906817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3996  hypothetical protein  54.17 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  60.98 
 
 		 144 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  54.01 
 
 		 202 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  58.26 
 
 		 294 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  57.76 
 
 		 194 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5334  hypothetical protein  55.08 
 
 		 297 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418335  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  50 
 
 		 155 aa  133  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  45.39 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  51.69 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  47.69 
 
 		 145 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  49.21 
 
 		 174 aa  122  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  45.32 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  50.43 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4980  hypothetical protein  50.39 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  47.5 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  44.8 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0309  hypothetical protein  37.42 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0622051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  42.52 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  41.73 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  39.49 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  39.04 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0813  hypothetical protein  42.11 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  41.13 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  40.32 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  41.13 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  38.3 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  37.59 
 
 		 134 aa  90.5  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  40.32 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  37.59 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  37.96 
 
 		 133 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  38.28 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  41.59 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  39.25 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  39.45 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  38.05 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  36.61 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3286  hypothetical protein  36.24 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1386  hypothetical protein  40.35 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000107026  normal  0.0105588 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  31.58 
 
 		 218 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2014  hypothetical protein  27.89 
 
 		 254 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0836382 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  28.95 
 
 		 202 aa  46.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0076  hypothetical protein  28.21 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>