56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5063 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  313  6e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  94.94 
 
 		 158 aa  299  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  94.3 
 
 		 158 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0309  hypothetical protein  93.67 
 
 		 158 aa  295  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0622051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  51.27 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  52.53 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  54.67 
 
 		 145 aa  157  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  54.67 
 
 		 145 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  54.67 
 
 		 145 aa  157  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  53.8 
 
 		 141 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4980  hypothetical protein  50.74 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  48.39 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  46.5 
 
 		 149 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  46.5 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  47.74 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  47.1 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  42.76 
 
 		 202 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  45.57 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  48 
 
 		 174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  43.28 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  44.52 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  44.03 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  40.67 
 
 		 194 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  50.4 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  50.4 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  50.4 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  50.4 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  50.4 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  50.4 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  47.2 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  39.24 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3996  hypothetical protein  41.56 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  49.6 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3840  hypothetical protein  46.09 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.906817 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  42.34 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  39.49 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0924  hypothetical protein  40.4 
 
 		 142 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  38.75 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  46.4 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  45.11 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  44.59 
 
 		 133 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  46.77 
 
 		 294 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  46.28 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  40.41 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5334  hypothetical protein  44.06 
 
 		 297 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418335  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0468  hypothetical protein  40.26 
 
 		 168 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  41.94 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  48.74 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  42.86 
 
 		 148 aa  94  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  38.26 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0813  hypothetical protein  41.3 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1386  hypothetical protein  36 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000107026  normal  0.0105588 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  38.46 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3286  hypothetical protein  35.16 
 
 		 277 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  31.25 
 
 		 218 aa  51.2  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  29.46 
 
 		 202 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>