56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3307 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5334  hypothetical protein  50.33 
 
 		 297 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418335  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  53.6 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  50.35 
 
 		 141 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  50.36 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  56.78 
 
 		 294 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  47.33 
 
 		 167 aa  130  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  52.42 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  52.42 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  52.42 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0468  hypothetical protein  50.35 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  48.95 
 
 		 141 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  48.91 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4980  hypothetical protein  50.41 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  47.58 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  42.95 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  50.44 
 
 		 145 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0309  hypothetical protein  45.93 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0622051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  44.83 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0924  hypothetical protein  46.85 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  44.78 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  46.27 
 
 		 194 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  46.22 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3996  hypothetical protein  46.22 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  44.44 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  43.7 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3840  hypothetical protein  46.67 
 
 		 142 aa  111  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.906817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  49.14 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  49.09 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  50.43 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  44.12 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  49.57 
 
 		 149 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  49.57 
 
 		 134 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  48.7 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  48.7 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  46.79 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0813  hypothetical protein  48.82 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  48.72 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  49.57 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  49.11 
 
 		 135 aa  96.7  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  41.26 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  39.71 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  46.43 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  46.43 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  46.43 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  46.43 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  46.43 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  46.43 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  40.29 
 
 		 133 aa  90.1  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1386  hypothetical protein  43.44 
 
 		 268 aa  88.2  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000107026  normal  0.0105588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  43.93 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3286  hypothetical protein  39.06 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  41.07 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  32.23 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  30.58 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>