56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2598 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  59.2 
 
 
134 aa  157  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  59.2 
 
 
149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  59.2 
 
 
134 aa  153  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  58.4 
 
 
134 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  57.6 
 
 
134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  57.6 
 
 
134 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  63.39 
 
 
133 aa  150  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  56.8 
 
 
146 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  59.06 
 
 
133 aa  148  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  65.74 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  65.74 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  65.74 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  65.74 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  65.74 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  65.74 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  61.47 
 
 
135 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  55.3 
 
 
133 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  63.81 
 
 
133 aa  140  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  54.46 
 
 
142 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  49.15 
 
 
145 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  46.56 
 
 
145 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  46.28 
 
 
158 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  40.85 
 
 
141 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  50.46 
 
 
145 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  50.46 
 
 
145 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  50.46 
 
 
145 aa  100  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  46.28 
 
 
158 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  44.09 
 
 
158 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  41.35 
 
 
194 aa  98.2  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0309  hypothetical protein  46.28 
 
 
158 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0622051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  48.21 
 
 
174 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  47.27 
 
 
124 aa  92.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  43.24 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  43.12 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  39.86 
 
 
155 aa  87.8  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  44.25 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3996  hypothetical protein  41.8 
 
 
144 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  46.43 
 
 
149 aa  83.6  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  35.29 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4980  hypothetical protein  46.09 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  42.11 
 
 
202 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  45.36 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  44.04 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  47.47 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3840  hypothetical protein  42.34 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.906817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5334  hypothetical protein  44.95 
 
 
297 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418335  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0924  hypothetical protein  37.32 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  40.74 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  40.19 
 
 
218 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  39.25 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  40.19 
 
 
167 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0468  hypothetical protein  39.56 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3286  hypothetical protein  36.89 
 
 
277 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0813  hypothetical protein  44.55 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1386  hypothetical protein  35.79 
 
 
268 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000107026  normal  0.0105588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>