57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5295 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  92.41 
 
 		 145 aa  276  9e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  66.91 
 
 		 145 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  66.91 
 
 		 145 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  66.91 
 
 		 145 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0309  hypothetical protein  53.16 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0622051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  51.9 
 
 		 158 aa  161  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  51.27 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  50.63 
 
 		 158 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4980  hypothetical protein  57.03 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  50.34 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0924  hypothetical protein  53.57 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3996  hypothetical protein  52.82 
 
 		 144 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  54.4 
 
 		 145 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  54.4 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  58.62 
 
 		 144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  52.5 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  53.33 
 
 		 141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  49.28 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  48.53 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3840  hypothetical protein  53.78 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.906817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  47.69 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0468  hypothetical protein  51.49 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  47.97 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  45.14 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  47.79 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  44.53 
 
 		 202 aa  121  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  47.79 
 
 		 134 aa  120  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  47.06 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  44.44 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  46.83 
 
 		 194 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0813  hypothetical protein  51.94 
 
 		 147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  45.59 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  48.41 
 
 		 294 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5334  hypothetical protein  47.01 
 
 		 297 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418335  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  46.49 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  47.2 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  43.66 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  45.59 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  49.15 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  48.21 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  40.28 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  49.53 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  49.11 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  49.11 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  49.11 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  49.11 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  49.11 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  49.11 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  44.53 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  44.83 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3286  hypothetical protein  41.67 
 
 		 277 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1386  hypothetical protein  40 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000107026  normal  0.0105588 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  38.74 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  36.44 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  33.67 
 
 		 202 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2014  hypothetical protein  31.15 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0836382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>