57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5388 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5388  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5209  hypothetical protein  55.06 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5156  hypothetical protein  54.43 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.900175  normal  0.806894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0309  hypothetical protein  53.8 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0622051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5063  hypothetical protein  53.8 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4853  hypothetical protein  52.41 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5295  hypothetical protein  50.34 
 
 		 145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2603  hypothetical protein  46.27 
 
 		 194 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1301  hypothetical protein  45.93 
 
 		 202 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1750  hypothetical protein  48.61 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2398  hypothetical protein  48.61 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2383  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0923  twin-arginine translocation pathway signal  45.39 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0408  hypothetical protein  47.59 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2112  hypothetical protein  47.59 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04100  hypothetical protein  47.59 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.991975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2362  hypothetical protein  49.3 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2280  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0917  hypothetical protein  47.89 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.064586 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3841  hypothetical protein  41.55 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.912828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2123  hypothetical protein  47.86 
 
 		 174 aa  121  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.884849 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5701  hypothetical protein  46.48 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3995  hypothetical protein  48.8 
 
 		 167 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0938  hypothetical protein  53.57 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7161  hypothetical protein  47.9 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3307  rod shape-determining protein RodA  45.11 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.460384  normal  0.047628 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5334  hypothetical protein  53.04 
 
 		 297 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0418335  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5031  hypothetical protein  53.57 
 
 		 294 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0469  hypothetical protein  48.74 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3840  hypothetical protein  47.9 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.906817 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3996  hypothetical protein  45.26 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2093  hypothetical protein  47.24 
 
 		 148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2088  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1143  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1135  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952935  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2524  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0692  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2206  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4980  hypothetical protein  53.04 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0468  hypothetical protein  45.86 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3341  hypothetical protein  45.71 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0924  hypothetical protein  42.45 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3054  hypothetical protein  41.03 
 
 		 165 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0257  hypothetical protein  42.57 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2338  hypothetical protein  44.92 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.265688 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0280  hypothetical protein  44.35 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.868803  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2126  hypothetical protein  43.57 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.266796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1203  hypothetical protein  49.53 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2598  hypothetical protein  40.85 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.293083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1175  hypothetical protein  41.88 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984059 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0813  hypothetical protein  42.64 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27592  predicted protein  45.95 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.195596  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2585  hypothetical protein  35.04 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1386  hypothetical protein  34.31 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000107026  normal  0.0105588 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3286  hypothetical protein  31.25 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4545  hypothetical protein  32.76 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.487008  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2014  hypothetical protein  30.43 
 
 		 254 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0836382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>