25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3298 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3298  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.458049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4136  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.54 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4885  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.58 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1751  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.46 
 
 
155 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  28.08 
 
 
136 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2703  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  26.21 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0409  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
504 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0400  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
504 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0388  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
507 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  22.22 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.11 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0624  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 
503 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  33.33 
 
 
181 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13358  predicted protein  27.72 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22620  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  34.62 
 
 
517 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0117  FAD dependent oxidoreductase  43.24 
 
 
518 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.827843 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3146  Rieske Fe-S protein  31.43 
 
 
269 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.237572  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  30.88 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0732  FAD dependent oxidoreductase  43.24 
 
 
502 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.881858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.43 
 
 
124 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.43 
 
 
124 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  24.43 
 
 
124 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40083  Rieske iron-sulfur protein of cytochrome b6f  35.9 
 
 
216 aa  41.2  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  28.79 
 
 
182 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 
513 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>