89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1286 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1286  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  100 
 
 
104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  55.1 
 
 
104 aa  126  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30.77 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  30.93 
 
 
170 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0893  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.67 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203676  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 
171 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  31.34 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.7 
 
 
134 aa  50.4  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.85 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0720  Rieske (2Fe-2S) region  29.13 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.457021  normal  0.579853 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0562  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.44 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  35.9 
 
 
124 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.58 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  30.3 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.9 
 
 
124 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.89 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.9 
 
 
124 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2894  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.77 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.68 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  28.21 
 
 
151 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5838  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.592792  hitchhiker  0.000871266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.33 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5690  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.55 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.4 
 
 
123 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.4 
 
 
155 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3552  p-cumate dioxygenase ferredoxin subunit (CmtAd)  26.14 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0237273  normal  0.331146 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.92 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.75 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5985  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  32.94 
 
 
105 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  0.294982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.71 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  29.33 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1461  FAD dependent oxidoreductase  34.94 
 
 
521 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  32.47 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.11 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1970  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
109 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.58 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.91 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  26.53 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.16 
 
 
105 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1329  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.79 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316396  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.03 
 
 
529 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.03 
 
 
529 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  26.53 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.26 
 
 
160 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.92 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  32.58 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  30 
 
 
270 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2955  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.59 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.38 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1708  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  26.97 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.78764  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  27.36 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  28.57 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.16 
 
 
103 aa  42.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2677  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30.77 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.85 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.5 
 
 
513 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.28 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  23.53 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2679  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25.84 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.95 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.67 
 
 
105 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3052  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.13 
 
 
135 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.279296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  26.74 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.74 
 
 
105 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0977  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.33 
 
 
212 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1987  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.37 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  27.45 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3377  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  34.43 
 
 
178 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.719786  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.25 
 
 
516 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  22.77 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1405  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.96 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1263  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.78 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.227252  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2879  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.43 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.388175  normal  0.0551812 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.43 
 
 
640 aa  40.4  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0406  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.05 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.16 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.48 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00196635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3529  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  23.91 
 
 
152 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.94 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  32.84 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2095  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  24.53 
 
 
108 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0602377  normal  0.0657417 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3247  Rieske (2Fe-2S) region  25.51 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206921  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.73 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.53 
 
 
114 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1780  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  27.55 
 
 
105 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.307476  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  28.89 
 
 
136 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>