29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3715 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 550 aa  1117    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  39.18 
 
 		 536 aa  401  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  43.91 
 
 		 539 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  43.73 
 
 		 539 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  43.65 
 
 		 539 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  43.91 
 
 		 539 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  43.91 
 
 		 539 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  44.49 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  44.49 
 
 		 540 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  42.65 
 
 		 555 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  43.39 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  43.36 
 
 		 539 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  42.54 
 
 		 487 aa  365  2e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  42.47 
 
 		 540 aa  364  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  42.47 
 
 		 540 aa  364  3e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  43.93 
 
 		 543 aa  349  9e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  45.49 
 
 		 582 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  42.78 
 
 		 583 aa  310  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  41.96 
 
 		 562 aa  307  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  37.15 
 
 		 580 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  25 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  23.26 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.268529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  25.28 
 
 		 650 aa  56.6  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  24.86 
 
 		 634 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  36 
 
 		 431 aa  48.1  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  27.44 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  27.44 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  38.81 
 
 		 505 aa  45.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3795  putative flavin-containing monooxygenase  26.4 
 
 		 514 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.790052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>