27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4119 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  88.48 
 
 		 540 aa  977    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  88.48 
 
 		 540 aa  977    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  100 
 
 		 540 aa  1084    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  100 
 
 		 540 aa  1084    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  53.56 
 
 		 539 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  53.75 
 
 		 539 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  53.38 
 
 		 539 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  53.38 
 
 		 539 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  53.56 
 
 		 539 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  53.38 
 
 		 539 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  51.99 
 
 		 555 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  53.48 
 
 		 556 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  43.61 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  34.81 
 
 		 536 aa  309  9e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  38.31 
 
 		 543 aa  249  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  40.79 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  40.26 
 
 		 582 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  39.36 
 
 		 583 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  33.48 
 
 		 580 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2308  glycine/D-amino acid oxidases  59.65 
 
 		 58 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2225  hypothetical protein  56.14 
 
 		 58 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.444853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1722  hypothetical protein  54.39 
 
 		 58 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1929  hypothetical protein  54.39 
 
 		 58 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1656  hypothetical protein  54.39 
 
 		 58 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0705  hypothetical protein  53.85 
 
 		 53 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  33.01 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>