35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3462 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  70.18 
 
 		 555 aa  762    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  100 
 
 		 556 aa  1109    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  59.82 
 
 		 539 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  59.75 
 
 		 539 aa  628  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  59.82 
 
 		 539 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  59.75 
 
 		 539 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  59.82 
 
 		 539 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  59.21 
 
 		 539 aa  623  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  54.25 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  54.25 
 
 		 540 aa  512  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  52.76 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  52.76 
 
 		 540 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  43.39 
 
 		 550 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  35.77 
 
 		 536 aa  317  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5265  amine oxidase  41.03 
 
 		 543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  37.07 
 
 		 487 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4735  amine oxidase  39.81 
 
 		 582 aa  236  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0250  hypothetical protein  38.65 
 
 		 562 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4093  twin-arginine translocation pathway signal  39.64 
 
 		 583 aa  233  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.139116 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4784  twin-arginine translocation pathway signal  33.26 
 
 		 580 aa  187  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370329  normal  0.538612 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2308  glycine/D-amino acid oxidases  64.81 
 
 		 58 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2225  hypothetical protein  58.93 
 
 		 58 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.444853  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1722  hypothetical protein  57.14 
 
 		 58 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1929  hypothetical protein  57.14 
 
 		 58 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1656  hypothetical protein  57.14 
 
 		 58 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0705  hypothetical protein  55.77 
 
 		 53 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  30.46 
 
 		 699 aa  48.9  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  24.85 
 
 		 644 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  50 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  24.31 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0609  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.6 
 
 		 492 aa  46.2  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0291397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 441 aa  45.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1737  putative NADPH-dependent glutamate synthase small subunit  46.94 
 
 		 654 aa  44.3  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0256396 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 		 436 aa  43.5  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>