21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1929 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1656  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1722  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1929  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2225  hypothetical protein  93.1 
 
 
58 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.444853  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2308  glycine/D-amino acid oxidases  89.66 
 
 
58 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0705  hypothetical protein  92.45 
 
 
53 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5392  hypothetical protein  77.59 
 
 
539 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0815  hypothetical protein  79.31 
 
 
539 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3472  hypothetical protein  77.59 
 
 
539 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4894  hypothetical protein  77.59 
 
 
539 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4801  hypothetical protein  77.59 
 
 
539 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.717214  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4274  hypothetical protein  77.59 
 
 
539 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3462  hypothetical protein  57.14 
 
 
556 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05692  putative transmembrane protein  53.45 
 
 
540 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04763  hypothetical protein  53.45 
 
 
540 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4119  amine oxidase  54.39 
 
 
540 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.670379  normal  0.0166866 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4231  amine oxidase  54.39 
 
 
540 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.179579  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3305  hypothetical protein  57.14 
 
 
555 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0711795  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0112  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
487 aa  51.2  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0699636 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  48.15 
 
 
550 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1568  twin-arginine translocation pathway signal  44.83 
 
 
536 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>