76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0806 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0806  amine oxidase  100 
 
 
726 aa  1469    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19061  hypothetical protein  27.67 
 
 
737 aa  242  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.227991 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  24.84 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  50 
 
 
479 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.5 
 
 
490 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  42.03 
 
 
436 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  43.28 
 
 
436 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  42.03 
 
 
436 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  42.03 
 
 
436 aa  51.6  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  43.28 
 
 
436 aa  51.6  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  40.58 
 
 
436 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  27.23 
 
 
471 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1288  hypothetical protein  34.17 
 
 
531 aa  50.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183954  hitchhiker  0.00478121 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  51.85 
 
 
537 aa  49.3  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  43.28 
 
 
508 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  40.3 
 
 
436 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  42.19 
 
 
495 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  40.3 
 
 
436 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  42.19 
 
 
495 aa  49.3  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  41.79 
 
 
511 aa  48.5  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  43.64 
 
 
245 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.32 
 
 
478 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.32 
 
 
478 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  45.28 
 
 
484 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3192  hypothetical protein  29 
 
 
560 aa  47.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  45.16 
 
 
507 aa  47.8  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  25.74 
 
 
474 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  40.3 
 
 
436 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  25.44 
 
 
478 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  20.99 
 
 
487 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  26.5 
 
 
488 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  20.99 
 
 
482 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  20.99 
 
 
482 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  32.5 
 
 
453 aa  46.2  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  19.54 
 
 
431 aa  46.2  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  46.51 
 
 
573 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  37.1 
 
 
445 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  45 
 
 
463 aa  46.6  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01400  conserved hypothetical protein  51.92 
 
 
470 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  45.61 
 
 
511 aa  46.6  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  42.59 
 
 
476 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  21.29 
 
 
485 aa  46.6  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  50.91 
 
 
426 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  26.09 
 
 
487 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3377  amine oxidase  28.57 
 
 
445 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.719601  normal  0.101039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1544  amine oxidase  24.24 
 
 
504 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268529 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  47.06 
 
 
469 aa  45.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.38 
 
 
523 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  36.92 
 
 
436 aa  45.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  40 
 
 
505 aa  45.1  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  39.71 
 
 
628 aa  45.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  39.44 
 
 
535 aa  44.7  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  47.37 
 
 
480 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  39.02 
 
 
938 aa  44.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  42.86 
 
 
508 aa  44.7  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  51.85 
 
 
450 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4951  squalene-hopene cyclase  37.96 
 
 
657 aa  44.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.736263  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  46.15 
 
 
571 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  51.85 
 
 
450 aa  44.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  39.51 
 
 
504 aa  44.3  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5504  squalene-hopene cyclase  37.96 
 
 
657 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209876  normal  0.0256677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  22.52 
 
 
487 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.23 
 
 
478 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.43 
 
 
456 aa  44.3  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25.22 
 
 
478 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.22 
 
 
478 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1320  Terpene synthase/squalene cyclase  27.68 
 
 
659 aa  44.3  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.22 
 
 
478 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  37.7 
 
 
519 aa  44.3  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  26.36 
 
 
490 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  41.18 
 
 
530 aa  43.9  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  26.36 
 
 
490 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  47.37 
 
 
494 aa  43.9  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.22 
 
 
478 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  30.56 
 
 
512 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  39.06 
 
 
491 aa  43.9  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>