38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3251 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3251  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
371 aa  766    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20990  glycosyltransferase  28.46 
 
 
755 aa  117  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1494  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
399 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  28.29 
 
 
398 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
386 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2305  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
402 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2531  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
390 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
390 aa  49.7  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1650  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0984148  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  23.68 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
396 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  24.48 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3689  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.466266  normal  0.187253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1624  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
414 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  36.36 
 
 
754 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  32.35 
 
 
741 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0316  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
424 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.451798  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  24.29 
 
 
440 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  31.25 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 
452 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  21.97 
 
 
517 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 
393 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
401 aa  43.5  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
447 aa  43.5  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
428 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
1275 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
391 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 
394 aa  43.1  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
386 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 
361 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4581  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
416 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.23572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>