More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2841 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2841  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 420 aa  841    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2472  glycosyl transferase group 1  80.34 
 
 		 419 aa  648    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3369  glycosyl transferase group 1  58.01 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0357213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4279  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024185  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 410 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  33 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 419 aa  112  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.73 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 386 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 360 aa  94  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.05 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  36.13 
 
 		 382 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.66 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  35.94 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 417 aa  90.1  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  25.79 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 360 aa  89.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 375 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 395 aa  86.7  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  21.98 
 
 		 427 aa  86.7  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.26 
 
 		 401 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  33.7 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  28.08 
 
 		 536 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  25.32 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  23.43 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 		 370 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 		 435 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  28.27 
 
 		 716 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.79 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  27.36 
 
 		 650 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 810 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  23.58 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  25.74 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3085  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 378 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  25 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  32.97 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3449  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  26.38 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  27.91 
 
 		 362 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1143  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1427  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.96 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  23.77 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  30.19 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0294  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  27.96 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>