More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4938 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  100 
 
 		 379 aa  758    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4987  glycosyl transferase group 1  92.29 
 
 		 363 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  98.62 
 
 		 363 aa  712    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.16 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 750 aa  97.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  34.08 
 
 		 376 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  32.88 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  35.84 
 
 		 361 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  33.95 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  34.08 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  40.4 
 
 		 398 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0587  glycosyl transferase, group 1  31.65 
 
 		 372 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.862017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.33 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2188  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.891642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  44.92 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  34.18 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 739 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  33.68 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  32.57 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  36.67 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  32.95 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  32.94 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  35.84 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  41.18 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0477  glycosyl transferase, group 1  37.13 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.54725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  41.59 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.42 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  39.57 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  44.66 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  34.09 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1026  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 341 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0632  glycosyl transferase group 1  32.02 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 1264 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  33.93 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  40.34 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  35.76 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 		 363 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  36.3 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  39.72 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  38.61 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 391 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  39.72 
 
 		 388 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  39.39 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  37.11 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  29.81 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  42 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  38.61 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  30.39 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.87 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 		 398 aa  73.9  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.03 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  30.04 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  37.97 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  37.97 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  30.1 
 
 		 376 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  29.63 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1345  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.5 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.976414 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  36.55 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  28.99 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  34.17 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 		 377 aa  72  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.23 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  41.13 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>