More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1026 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1026  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
341 aa  696    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0694  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
346 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1141  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.35 
 
 
397 aa  99  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  30.7 
 
 
350 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
377 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
377 aa  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
369 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
374 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
750 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  25.25 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.09 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4938  glycosyl transferase, putative  32.37 
 
 
379 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4810  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  26.03 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  27.39 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  25.09 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  29.3 
 
 
366 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 
371 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 
412 aa  75.9  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1110  glycosyl transferase, group 1  26.26 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4987  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0201  a-glycosyltransferase  31.47 
 
 
356 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 
369 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  24.91 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0941  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
325 aa  72  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.018842  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
370 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1007  glycosyl transferase, group 1  24.61 
 
 
416 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.643015  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
372 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3661  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  23.92 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  23.93 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  23.93 
 
 
371 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0780  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.716964  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13801  hypothetical protein  30.11 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.8447  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3592  glycosyl transferase group 1  22.78 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  32.56 
 
 
638 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2084  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.573542 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.46 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  22.03 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 
369 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  24.82 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
689 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.1 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.75 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  22.1 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  23.05 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3504  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.33 
 
 
367 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
468 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.79 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
372 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.89 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  23.59 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.03 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  22.03 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2458  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 
355 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1146  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00446094  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
392 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  22.7 
 
 
366 aa  65.9  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
739 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  25.17 
 
 
421 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  29.23 
 
 
425 aa  66.2  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0375  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
383 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2889  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.228881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 
346 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  32.87 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  28.8 
 
 
448 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  32.87 
 
 
350 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  26.47 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.15 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4183  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  25.97 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 
388 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  32.17 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  29.45 
 
 
440 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0283  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
360 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
350 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2978  glycosyltransferase-like protein  27.31 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
377 aa  63.5  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
396 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1144  general glycosylation pathway protein  29.45 
 
 
365 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2418  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.07 
 
 
370 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00701147  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  24.04 
 
 
393 aa  63.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0594  general glycosylation pathway protein  29.45 
 
 
365 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1445  glycosyl transferase group 1  24.07 
 
 
370 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1616  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
358 aa  62.8  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>