94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0563 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0563  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  796    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  23.54 
 
 
397 aa  89.7  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  24.18 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
994 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  21.43 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  31.37 
 
 
1119 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  24.1 
 
 
400 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  26.72 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 
389 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  23 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  27.27 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  34.23 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  25.62 
 
 
443 aa  67  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  21.36 
 
 
404 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  23.14 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0351  Glycosyltransferase-like protein  30.69 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
956 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
401 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
413 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  25.13 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  21.45 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  30.28 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0332  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  28.29 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  26.27 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  23.19 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
392 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  22.61 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  22.8 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  24.61 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.22 
 
 
429 aa  60.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  24.8 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  23.46 
 
 
414 aa  60.1  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 
402 aa  59.7  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
422 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 
388 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0151  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105707  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  21.05 
 
 
1106 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
417 aa  56.6  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  20.43 
 
 
412 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
417 aa  56.2  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4239  hypothetical protein  20.95 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.333898  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  22.4 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
394 aa  55.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  19.58 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  24.88 
 
 
396 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2500  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.295677 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  21.12 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  22.8 
 
 
418 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  20.76 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  20.69 
 
 
537 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 
414 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  21.69 
 
 
399 aa  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1588  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603686  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  28.03 
 
 
860 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  20.86 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 
703 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  22.4 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 
535 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
760 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  22.51 
 
 
499 aa  47  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  21.96 
 
 
537 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0338  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
392 aa  46.6  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100877  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0297  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.855131  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  18.65 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
892 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  17.85 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  23.12 
 
 
410 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
1340 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  18.03 
 
 
700 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  23.21 
 
 
1156 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>