64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0297 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0297  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
407 aa  813    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.855131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  27.33 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0344  hypothetical protein  27.2 
 
 
370 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00179291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
432 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  22.87 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3527  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000428003  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2423  glycosyltransferase  23.35 
 
 
537 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.848309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  22.82 
 
 
1156 aa  55.8  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  18.45 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
402 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  22.35 
 
 
535 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  27.4 
 
 
1119 aa  53.5  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
892 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1326  hypothetical protein  24.21 
 
 
364 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0103885  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  24.79 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
402 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
418 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  23.72 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  21.46 
 
 
956 aa  50.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  23.58 
 
 
376 aa  50.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  17.92 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2061  glycosyltransferase  21.03 
 
 
537 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
703 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  21.43 
 
 
456 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  23.71 
 
 
860 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  24.47 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
399 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  22.81 
 
 
1340 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  23.92 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  26.88 
 
 
399 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  25.66 
 
 
413 aa  47  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1329  glycosyltransferase, putative  26.5 
 
 
412 aa  47  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
405 aa  47  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  25.86 
 
 
413 aa  47  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
406 aa  47  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0296  glycosyltransferase  29.06 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3307  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
405 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143388  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
499 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  31.96 
 
 
354 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  22.96 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  25 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0563  hypothetical protein  29.1 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  21.33 
 
 
392 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3802  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 
1348 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  25 
 
 
405 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  19.89 
 
 
417 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 
360 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  24.14 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2185  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
437 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  24.69 
 
 
402 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  22.95 
 
 
408 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  27.73 
 
 
402 aa  43.1  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  22.09 
 
 
1106 aa  43.1  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  21.83 
 
 
382 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  23.78 
 
 
402 aa  42.7  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>