More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6297 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
400 aa  828    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  43.61 
 
 
385 aa  320  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  42.01 
 
 
404 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  44.14 
 
 
406 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3259  glycosyl transferase group 1  41.9 
 
 
395 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115227  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  41.02 
 
 
394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  35.68 
 
 
397 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  28.57 
 
 
415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  28.75 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
396 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  25.99 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 
389 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.5 
 
 
383 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
389 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
384 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  27.95 
 
 
395 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  27.25 
 
 
395 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
388 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  26.93 
 
 
378 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
384 aa  91.3  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
399 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
384 aa  89.4  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.55 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.55 
 
 
398 aa  88.6  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4073  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.728215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  25.58 
 
 
400 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  23.9 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  38.66 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  22.17 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  24.55 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  38.33 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
402 aa  70.1  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1695  glycosyl transferase, group 1  32.39 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 
356 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
384 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
820 aa  66.6  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  31.03 
 
 
390 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5790  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
379 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
370 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
386 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 
355 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0244  glycosyl transferase, group 1  30.18 
 
 
393 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.270247 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13881  hypothetical protein  24.18 
 
 
364 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.812309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
860 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  30.34 
 
 
859 aa  63.5  0.000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.26 
 
 
409 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0604  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
819 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1682  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.88 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.961392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 
435 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
440 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
420 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  27.62 
 
 
390 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0853  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
398 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0682 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3613  glycosyl transferase domain-containing protein  28.57 
 
 
816 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.103069  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2517  glycosyl transferase, group 1  32.67 
 
 
356 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6345  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
364 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2869  glycosyl transferase, group 1  25.25 
 
 
816 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.541026 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05780  glycosyltransferase  23.27 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
373 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 
609 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 
391 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 
378 aa  60.1  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
426 aa  60.1  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
1915 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  21.57 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 
381 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0384  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
392 aa  59.7  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  27.14 
 
 
427 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0978  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
441 aa  59.7  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000121289 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.5 
 
 
405 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 
386 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
850 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4834  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0981123  hitchhiker  0.0000464938 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.43 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1524  glycosyl transferase, group 1  27.89 
 
 
379 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.986628  normal  0.661565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0989  UDP-N-acetylglucosamine  27.39 
 
 
458 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0884879  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1523  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
413 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.429358 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
1089 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  22.63 
 
 
353 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  28.24 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>