More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3337 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3337  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
417 aa  842    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.809351  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5792  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
388 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  30.48 
 
 
415 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0422  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
398 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0898466  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0365  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.5 
 
 
398 aa  150  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3375  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.133943  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  27.3 
 
 
396 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0253  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
384 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.674874  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1688  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
400 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  25.71 
 
 
391 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4093  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  27.38 
 
 
384 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  24.19 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
395 aa  116  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3856  putative transferase  30.12 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0895  a-glycosyltransferase  27.51 
 
 
390 aa  113  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000533271  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1034  glycosyl transferase group 1  24.22 
 
 
389 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13771  hypothetical protein  24.27 
 
 
359 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0828  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
406 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.933526  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1063  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 
389 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0481917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2884  a-glycosyltransferase  25.78 
 
 
370 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0290347  normal  0.0642732 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2464  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
394 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200032  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1362  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 
390 aa  99.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0392501  normal  0.0175449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2067  glycosyl transferase, group 1  25.28 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0419406  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4579  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  21.15 
 
 
392 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 
402 aa  96.3  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1160  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.13 
 
 
383 aa  94.7  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.121321  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0689  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
397 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.997173 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
395 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2610  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2550  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
384 aa  90.9  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.855079  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 
360 aa  90.5  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3907  glycosyl transferase group 1  21.79 
 
 
379 aa  89.7  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134945  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3183  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.306828  hitchhiker  0.00206766 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 
375 aa  84.3  0.000000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1443  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
363 aa  79  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.739499  hitchhiker  0.0000273098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.33 
 
 
385 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31.47 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1808  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0393  putative glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.336091  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04481  putative glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  22.98 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03941  putative glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2372  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
376 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00451515  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
391 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2017  glycosyltransferase  25.31 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.641598  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.37 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6297  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.223266 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2159  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  25.12 
 
 
376 aa  72.8  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2751  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 
519 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.39 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  22.38 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21451  putative glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  26.81 
 
 
367 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1460  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.17 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114403  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  22.82 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  24.04 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0727  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0832639  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
418 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  26.89 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0307  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.813373  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0985  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  25 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  26.07 
 
 
480 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  22.5 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6507  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2089  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
379 aa  68.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44458  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0964  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
613 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.84 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
371 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04171  putative glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.116045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2082  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
394 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  24.14 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  30.04 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
396 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
375 aa  67  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.1 
 
 
385 aa  67  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
391 aa  67  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
399 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04591  putative glycosyl transferase, group 1  21.45 
 
 
388 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.453112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>