More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2521 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
385 aa  768    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  56.25 
 
 
388 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  55.99 
 
 
388 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  57.03 
 
 
385 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  55.3 
 
 
388 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  55.09 
 
 
388 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  54.66 
 
 
388 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  55.26 
 
 
388 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  55 
 
 
388 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  54.66 
 
 
388 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  55.26 
 
 
388 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  54.62 
 
 
388 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.09 
 
 
388 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  55.09 
 
 
388 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  55.09 
 
 
388 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  53.58 
 
 
377 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  51.32 
 
 
382 aa  346  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  47.21 
 
 
398 aa  333  3e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  39.05 
 
 
390 aa  276  6e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  39.78 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1579  glycosyl transferase group 1  35.06 
 
 
358 aa  146  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 
368 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  34.2 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
446 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
395 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
417 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
373 aa  99.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 
377 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1746  glycosyl transferase, group 1  32.82 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
399 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.87 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
414 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
360 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.24 
 
 
408 aa  96.7  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  26.34 
 
 
358 aa  96.3  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 
413 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0459  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
418 aa  94.4  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.391248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 
359 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  29.76 
 
 
414 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
410 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1181  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 
395 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.192716  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
419 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
393 aa  90.1  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 
351 aa  89.7  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  28.09 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  27.05 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
380 aa  87  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  26.23 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 
360 aa  86.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
371 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
390 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
370 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  28.86 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  34.72 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.28 
 
 
935 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.2 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
414 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  28.57 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.75 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  32.69 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
355 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  35.94 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
391 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
383 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  25.39 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  30.14 
 
 
349 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  32.6 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  29.23 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.27 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
396 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  34.64 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  37.65 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.6 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
375 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
388 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.64 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
477 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  33.33 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>