More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1868 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 376 aa  758    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  53.8 
 
 		 374 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  58.31 
 
 		 344 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  49.46 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  50 
 
 		 374 aa  337  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  46.49 
 
 		 371 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  41.42 
 
 		 370 aa  295  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02625  glycosyltransferase  46.47 
 
 		 370 aa  293  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  42.05 
 
 		 372 aa  279  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0082  hypothetical protein  43.4 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0068  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 376 aa  257  2e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  38.58 
 
 		 383 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0811  glycosyl transferase  30.81 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.115304  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0824  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 432 aa  194  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.498308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1789  glycosyl transferase, group 1  31.12 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  31.3 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  39.75 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  36.48 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 		 409 aa  159  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  36.25 
 
 		 409 aa  159  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  35.53 
 
 		 428 aa  155  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 409 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  33.08 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  35.94 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 		 388 aa  146  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 431 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  35.13 
 
 		 409 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0640  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2108  glycosyl transferase group 1  38.25 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000441708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 384 aa  77  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3409  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  26.35 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 394 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  24.03 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  25.13 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  23.95 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1806  glycosyl transferase group 1  22.53 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 371 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  25 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  22.97 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2628  glycosyl transferase group 1  31.1 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00259804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  31.25 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.14 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  22.28 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 380 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1546  glycosyl transferase group 1  23.51 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00289117  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1517  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  24.62 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 422 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  21.78 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  20.12 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0802  a-glycosyltransferase  25.45 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022358 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  23.29 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  23.71 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  25 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 381 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.1 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.4 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.25 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  25.59 
 
 		 395 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.34 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 389 aa  62  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5430  glycosyl transferase group 1  22.44 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0841  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  21.65 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  29.03 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1421  glycogen synthase  27.12 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.62 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  26.01 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0336  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  22.92 
 
 		 590 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  22.89 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>