201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2108 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2108  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
444 aa  888    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000441708  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  45.65 
 
 
409 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  45.18 
 
 
409 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  45.65 
 
 
409 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0640  glycosyl transferase group 1  44.42 
 
 
418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  44.34 
 
 
409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  43.91 
 
 
428 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  44.44 
 
 
431 aa  302  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
379 aa  219  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
432 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  34.99 
 
 
388 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 
434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  31.28 
 
 
383 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
379 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 
374 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  38.25 
 
 
376 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 
374 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  36.65 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02625  glycosyltransferase  36.02 
 
 
370 aa  97.8  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  22.71 
 
 
358 aa  93.2  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0082  hypothetical protein  35.91 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
344 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0068  glycosyl transferase group 1  35.91 
 
 
376 aa  89  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
370 aa  86.3  9e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 
372 aa  86.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  28.49 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
383 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
406 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.39 
 
 
387 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  24.15 
 
 
650 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  22.28 
 
 
404 aa  63.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.28 
 
 
388 aa  63.2  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
406 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  24.19 
 
 
435 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
482 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
382 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  22.81 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 
396 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  22.71 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  26.76 
 
 
448 aa  57.4  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  20.88 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.35 
 
 
745 aa  57.4  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.52 
 
 
387 aa  57  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 
424 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 
381 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  26.76 
 
 
426 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  23.91 
 
 
371 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4437  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
387 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  24.2 
 
 
371 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  38.6 
 
 
387 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  25.43 
 
 
480 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0824  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
432 aa  53.5  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.498308  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
377 aa  53.1  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0811  glycosyl transferase  23.04 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.115304  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2619  hypothetical protein  31.96 
 
 
590 aa  52.8  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 
367 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 
384 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  21.94 
 
 
373 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  20.94 
 
 
385 aa  51.6  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1789  glycosyl transferase, group 1  21.18 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  23.27 
 
 
406 aa  51.2  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0365  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 
387 aa  51.2  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  25.89 
 
 
466 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  24.2 
 
 
398 aa  50.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  24.03 
 
 
426 aa  50.4  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
360 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  23.56 
 
 
390 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 
382 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2773  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
348 aa  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
383 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  26.42 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
367 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  24.59 
 
 
426 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  30.87 
 
 
408 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 
411 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  22.49 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  22.43 
 
 
369 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  23.7 
 
 
366 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  25.49 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1023  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
517 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.845251  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2900  glycosyl transferase, group 1  24.52 
 
 
421 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 
411 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.02 
 
 
536 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 
372 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  35.54 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.65 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 
394 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 
413 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>