More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0560 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0560  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
374 aa  752    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1868  putative glycosyltransferase  53.8 
 
 
376 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3769  glycosyl transferase group 1  54.16 
 
 
374 aa  388  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0467  glycosyl transferase group 1  54.46 
 
 
344 aa  353  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2130  glycosyl transferase group 1  47.68 
 
 
387 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0442  glycosyl transferase group 1  45.14 
 
 
370 aa  331  2e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.149003  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3348  glycosyl transferase group 1  47.17 
 
 
371 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02625  glycosyltransferase  46.58 
 
 
370 aa  301  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0798  glycosyl transferase, group 1  41.37 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0082  hypothetical protein  45.43 
 
 
376 aa  278  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0068  glycosyl transferase group 1  45.74 
 
 
376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1443  glycosyl transferase group 1  41.36 
 
 
383 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1789  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 
396 aa  200  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0811  glycosyl transferase  32.61 
 
 
409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.115304  normal  0.0283137 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0824  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.498308  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0657  glycosyltransferase  31.3 
 
 
358 aa  191  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.326106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3376  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 
432 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1198  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
388 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0121  glycosyl transferase, group 1  36.68 
 
 
382 aa  159  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1623  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
409 aa  149  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0129932 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1905  glycosyl transferase group 1  30.87 
 
 
409 aa  149  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.297933 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1613  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
409 aa  149  8e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.659761  hitchhiker  0.00171863 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0205  glycosyl transferase group 1  34.92 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3159  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 
428 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2146  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
434 aa  139  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322466  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4741  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 
409 aa  135  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.506008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4231  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979422 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2194  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
379 aa  117  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0354582  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0640  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
418 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
335 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2108  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
444 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000441708  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
382 aa  94  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1655  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 
384 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.6 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  25.6 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25.6 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25.6 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.6 
 
 
381 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.6 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.52 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.6 
 
 
381 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.37 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
387 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  25.89 
 
 
361 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
373 aa  82  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0029  glycosyltransferase  25.71 
 
 
392 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000827208  hitchhiker  0.00854387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0144  glycosyltransferase-like protein  25.96 
 
 
368 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0586  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.94 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000129984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.49 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  27.19 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  25.88 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  23.96 
 
 
350 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.38 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.68 
 
 
377 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.31 
 
 
408 aa  77  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  23.51 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  23.26 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  25.8 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3573  glycosyl transferase, group 1  25.38 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.823094  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4031  glycosyl transferase, group 1  24.46 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.317277  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3111  group 1 glycosyl transferase  25.73 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  25.39 
 
 
393 aa  73.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4413  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
383 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5176  glycosyl transferase group 1  30.67 
 
 
394 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.237852  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  28.1 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  21.91 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  23.47 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0797  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0180  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1189  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  22.57 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  25.5 
 
 
650 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  21.85 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  24.53 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1028  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.84 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
395 aa  69.3  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
381 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2078  glycosyl transferase group 1  23.1 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4182  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  26.36 
 
 
364 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  25.07 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2479  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0145757  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>