More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1643 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 503 aa  1036    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  54.25 
 
 		 503 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  50.51 
 
 		 512 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  50.2 
 
 		 526 aa  490  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  48.31 
 
 		 550 aa  485  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  48.89 
 
 		 538 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  47.51 
 
 		 550 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  47.18 
 
 		 503 aa  477  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  48.61 
 
 		 540 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  46.17 
 
 		 505 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  49.49 
 
 		 529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  48.21 
 
 		 537 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  47.98 
 
 		 507 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  48.31 
 
 		 518 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  49.3 
 
 		 529 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  46 
 
 		 507 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  47.39 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  46.71 
 
 		 500 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  48.99 
 
 		 527 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  47.11 
 
 		 510 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  42.37 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  38.74 
 
 		 502 aa  324  2e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  36.01 
 
 		 570 aa  273  7e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.84 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.84 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  34.82 
 
 		 503 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 		 468 aa  254  3e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 		 471 aa  253  6e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.49 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  32.86 
 
 		 467 aa  230  6e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 412 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 		 568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  36.4 
 
 		 606 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 500 aa  152  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  25.66 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 398 aa  94.4  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 372 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 387 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 413 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  22.77 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08369  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14070)  30 
 
 		 2822 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 387 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 		 1080 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 386 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 453 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  24.43 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  23.15 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  26.09 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13003  putative Capsular polysaccharide biosynthesis glycosyl transferase  26.24 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0395789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 371 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 380 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  30.82 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  28.05 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  28.51 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.46 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  29.08 
 
 		 383 aa  72  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3740  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  28.64 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.939916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0056  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  25.4 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  23.89 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0957  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.599861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  29.19 
 
 		 822 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  22.73 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  29.25 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3402  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.838483  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  27.23 
 
 		 725 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 378 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.91 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>