More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1969 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 503 aa  1040    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  63.47 
 
 		 505 aa  697    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  56.09 
 
 		 537 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  55.6 
 
 		 540 aa  581  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  55.21 
 
 		 518 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  56.54 
 
 		 529 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  55.4 
 
 		 529 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  53.75 
 
 		 512 aa  558  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  54.18 
 
 		 510 aa  554  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  52.31 
 
 		 538 aa  551  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  51.61 
 
 		 550 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  53.49 
 
 		 527 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  52.39 
 
 		 507 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  51.2 
 
 		 550 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  50.71 
 
 		 526 aa  522  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  50.4 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  45.27 
 
 		 504 aa  487  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  46.09 
 
 		 503 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  47.9 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  47.88 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  47.18 
 
 		 503 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  39.92 
 
 		 502 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  35.18 
 
 		 570 aa  291  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  32.72 
 
 		 471 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  34.25 
 
 		 503 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.66 
 
 		 473 aa  264  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.66 
 
 		 473 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 		 516 aa  260  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  33.06 
 
 		 467 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  30.86 
 
 		 468 aa  240  5e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.47 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  33.42 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  31.87 
 
 		 606 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 		 568 aa  170  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  27.47 
 
 		 505 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  24.29 
 
 		 486 aa  117  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 381 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.15 
 
 		 385 aa  90.5  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 395 aa  87.8  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 398 aa  86.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  25.8 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 904 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08369  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14070)  33.52 
 
 		 2822 aa  82.4  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 391 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  22.32 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  23.53 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02955  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07860)  29.26 
 
 		 2880 aa  76.6  0.0000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 		 383 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  29.96 
 
 		 387 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  27.35 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 380 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.16 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2890  glycosyltransferase-like protein  27.11 
 
 		 389 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  27.04 
 
 		 416 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  30.45 
 
 		 370 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 388 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  22.26 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  22.39 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  28.68 
 
 		 350 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.14 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  26.24 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 362 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 396 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  26.58 
 
 		 390 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  27.23 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.87 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3906  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 		 416 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>