More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1038 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5541  glycosyl transferase group 1  67.52 
 
 
518 aa  733    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1038  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
512 aa  1046    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.475069  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0768  glycosyl transferase, group 1  78.66 
 
 
510 aa  809    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0343515 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5285  glycosyl transferase group 1  59.88 
 
 
527 aa  609  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64584  normal  0.253586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2076  glycosyl transferase group 1  59.36 
 
 
540 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.323693  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2469  glycosyl transferase group 1  58.96 
 
 
537 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0021  glycosyl transferase group 1  60.44 
 
 
507 aa  600  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0958186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2271  hypothetical protein  58.51 
 
 
529 aa  591  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.237917 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  56.74 
 
 
550 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4160  hypothetical protein  57.88 
 
 
529 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0468499  normal  0.187813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  56.94 
 
 
538 aa  578  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  53.75 
 
 
503 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  57.23 
 
 
550 aa  571  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  54.33 
 
 
505 aa  568  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1732  glycosyl transferase, group 1  52.37 
 
 
526 aa  544  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.532923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1899  glycosyl transferase, group 1  52.86 
 
 
512 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.815758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  53.82 
 
 
500 aa  528  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24550  hypothetical protein  52.29 
 
 
507 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2434  glycosyl transferase, group 1  47.46 
 
 
503 aa  495  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0533  glycosyl transferase group 1  45.17 
 
 
504 aa  490  1e-137  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000739824  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1643  glycosyl transferase, group 1  47.39 
 
 
503 aa  445  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  37.68 
 
 
502 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  36.02 
 
 
570 aa  303  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  37.08 
 
 
503 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.12 
 
 
473 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.12 
 
 
473 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1626  glycosyl transferase, group 1  36.61 
 
 
516 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0797094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
468 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  29.18 
 
 
471 aa  238  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1131  glycosyltransferase  31.47 
 
 
467 aa  223  6e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00129132  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
463 aa  223  7e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1419  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
412 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5243  membrane protein-like protein  33.83 
 
 
606 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1838  glycosyl transferase group 1  28.69 
 
 
500 aa  157  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2909  glycosyl transferase group 1  24.24 
 
 
568 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 
505 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2529  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 
487 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0220634  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18890  glycosyltransferase  27.93 
 
 
486 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
395 aa  95.5  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
412 aa  93.6  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
398 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
434 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.7 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.43 
 
 
745 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
372 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08369  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14070)  33.7 
 
 
2822 aa  78.6  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1653  glycosyl transferase, group 1  28.2 
 
 
374 aa  77.8  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
380 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  27.42 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  22.28 
 
 
387 aa  76.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 
423 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
377 aa  75.1  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  32.09 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  34.85 
 
 
378 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4712  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 
391 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.590232 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02955  glycosyl transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07860)  31.61 
 
 
2880 aa  73.9  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  34.62 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3547  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  26.06 
 
 
393 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
435 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  32.26 
 
 
822 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  27.39 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  31.8 
 
 
370 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 
388 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
414 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 
403 aa  72  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 
387 aa  72  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
371 aa  72  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1999  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
408 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0297  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
371 aa  71.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
415 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12403  Glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0809877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  30.86 
 
 
745 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  28.77 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4438  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 
385 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  22.67 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  22.45 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  29 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  24.09 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>