More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4362 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4362  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
390 aa  804    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.95 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2418  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
396 aa  73.6  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392541  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  22.1 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 
380 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  30.11 
 
 
395 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
756 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2710  glycosyl transferase group 1  34.13 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.395873  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0660  putative lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.275219  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  30.9 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  22.85 
 
 
350 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0291  glycosyl transferase group 1  23.41 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.832234  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
359 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
374 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  21.72 
 
 
350 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  32.56 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3484  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13811  hypothetical protein  27.46 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  20.83 
 
 
350 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  21.72 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  28.75 
 
 
389 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2519  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  36.11 
 
 
384 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
386 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
750 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
397 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  23.71 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
395 aa  64.3  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
377 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  23.03 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1702  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
406 aa  63.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0871  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
383 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  37.86 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
374 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  27.44 
 
 
377 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1207  glycosyl transferase, group 1  22.04 
 
 
323 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  0.0214801 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 
396 aa  63.2  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 
415 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
380 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1431  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.83 
 
 
498 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6498  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
388 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 
378 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.49 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  32.23 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.53 
 
 
365 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3566  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
407 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  25.42 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  23.13 
 
 
371 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0405  glycosyl transferase group 1  33.66 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 
367 aa  62  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 
420 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.05 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1166  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.27899 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 
420 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3125  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
366 aa  60.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.44 
 
 
392 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
409 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  33.56 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0648  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  22.11 
 
 
431 aa  60.8  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.205035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3576  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
415 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  26.39 
 
 
367 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1045  group 1 glycosyl transferase  33.71 
 
 
353 aa  60.5  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000151909  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07651  glycosyltransferase  23.24 
 
 
365 aa  60.1  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457452  hitchhiker  0.00512375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5392  glycosyltransferase  25.86 
 
 
374 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
364 aa  60.1  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
406 aa  60.1  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3139  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.56 
 
 
400 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.425615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
699 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 
421 aa  60.1  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.5 
 
 
373 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  25.72 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 
371 aa  59.7  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  34.03 
 
 
400 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
382 aa  59.7  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.77 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>