More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0553 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0553  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 421 aa  873    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6402  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2250  putative glycosyltransferase  29.5 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1500  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  28.83 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 384 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1957  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.31 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  23.33 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1092  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  25.54 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0359  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.03 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.59 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.7 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.84 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  24.1 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.26 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 396 aa  67  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 768 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2615  glycosyl transferase, group 1  25.98 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  24.44 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  32.76 
 
 		 2401 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1800  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0485  putative glycosyl transferase  27.11 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  39.77 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1630  glycosyl transferase, group 1  39.77 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.83 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1001  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3261  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  21.91 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2494  glycosyl transferase group 1  24.51 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.044708  normal  0.0808495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.26 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  26.37 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.41 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5246  glycosyl transferase, group 1  29.21 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  34.78 
 
 		 1177 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2602  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 		 812 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.63 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2668  glycosyl transferase, group 1  23.85 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  29.68 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11043  glycosyltransferase  27.94 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.265999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 		 1177 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1812  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.41 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  24.86 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.68 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  22.97 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0567  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.923327  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4553  glycosyl transferase group 1  28.73 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.729319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  22.4 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 		 437 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>