More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6402 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6402  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 401 aa  832    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.406188 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0553  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 		 421 aa  110  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413341  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.55 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0638  glycosyl transferase group 1  23.74 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.650689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  23.49 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3055  glycosyl transferase, group 1  22.74 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01306  Glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0290  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.8 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  23.83 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  24.45 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  22.91 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  27.67 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  29.22 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  21.24 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3254  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.968094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.49 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  21.47 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 374 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 		 768 aa  65.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 398 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  24.45 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 		 373 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  25.49 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  20.63 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0245  glycosyl transferase group 1  28.38 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0624  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.225322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  27.89 
 
 		 438 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  30.59 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2078  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  21.72 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0670  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 		 371 aa  62  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  25.56 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.32 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  39.44 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  30.13 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 		 704 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.79 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.22 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  25 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0956  general glycosylation pathway protein  26.61 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.812105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4246  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 753 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 463 aa  60.5  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  23.37 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1396  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0657789  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3058  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1833  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2655  glycosyl transferase, group 1  23.96 
 
 		 395 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.268297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  26.7 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  27 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2745  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  22.12 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  21.97 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 		 374 aa  59.7  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  41.18 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.67 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1445  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000927133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  23.37 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  27.11 
 
 		 803 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  23.2 
 
 		 382 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 		 468 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1989  glycosyl transferase group 1  28.24 
 
 		 820 aa  58.5  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2328  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 871 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>