78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1005 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1600  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaC  98.77 
 
 		 405 aa  838    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01952  hypothetical protein  98.52 
 
 		 405 aa  835    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2992  putative glycosyl transferase  98.52 
 
 		 405 aa  837    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2453  putative glycosyl transferase  80.25 
 
 		 405 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.449849  normal  0.0475636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2238  putative glycosyl transferase  80.25 
 
 		 405 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2346  putative glycosyl transferase  80.25 
 
 		 405 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.31761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2339  putative glycosyl transferase  80.49 
 
 		 405 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.225754  normal  0.701653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2295  putative glycosyl transferase  80.49 
 
 		 405 aa  696    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0600773  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1175  putative glycosyl transferase  98.77 
 
 		 405 aa  838    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1005  putative glycosyl transferase  100 
 
 		 405 aa  850    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1584  putative glycosyl transferase  99.01 
 
 		 405 aa  841    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2350  putative glycosyl transferase  98.27 
 
 		 405 aa  832    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2671  putative glycosyl transferase  84.69 
 
 		 405 aa  729    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01963  predicted glycosyl transferase  98.52 
 
 		 405 aa  835    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  25.06 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  27.08 
 
 		 406 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  24.18 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  21.88 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  24.57 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  22.22 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.92 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.26 
 
 		 2401 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.95 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  22.75 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  21.18 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0507  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  22.06 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  26.1 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 366 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  22.89 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  21.91 
 
 		 362 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3880  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  23.12 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  30.83 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2121  glycosyltransferase-like protein  23.53 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.41241  normal  0.565016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  45.65 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  21.31 
 
 		 746 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0564  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  25.12 
 
 		 350 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  26.15 
 
 		 550 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  25.45 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 		 363 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5888  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.33 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1496  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 		 550 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.157519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2078  hypothetical protein  30.1 
 
 		 500 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1832  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 337 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04491  putative glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1961  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1261  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1732  putative glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  25.11 
 
 		 570 aa  43.9  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1926  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00887755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2105  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 353 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1833  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 		 538 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.546617  hitchhiker  0.000792757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 372 aa  43.9  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0698  glycosyl transferase group 1  24.12 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3255  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.37 
 
 		 372 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3291  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.37 
 
 		 372 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 304 aa  43.1  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 384 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 		 374 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>