253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1832 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1832  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
337 aa  676    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1499  glycosyl transferase, group 1  28.36 
 
 
371 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.415023  normal  0.860019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
381 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.3 
 
 
351 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
355 aa  60.8  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  27.75 
 
 
409 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.7 
 
 
385 aa  60.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  24.7 
 
 
372 aa  60.1  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
409 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 
392 aa  59.7  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3591  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
383 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3586  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
383 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3659  glycosyl transferase, group 1  29.86 
 
 
383 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.650107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17910  Glycosyl transferase, group 1 family protein  26.03 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0107761  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
304 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  28.65 
 
 
388 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 
370 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
394 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2801  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 
393 aa  56.2  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
391 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
394 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  25.53 
 
 
392 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 
394 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  25.71 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.29 
 
 
390 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0562  glycosyltransferase  30.88 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.841887  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2772  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
967 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.602029  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
346 aa  53.1  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2093  glycogen synthase  27.13 
 
 
395 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1496  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 
339 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
386 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0419  glycosyl transferase, group 1  23.26 
 
 
370 aa  52  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  25.55 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  31.07 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0518  putative glycosyltransferase protein  32.95 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3566  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
390 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0715685  normal  0.505955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5888  glycosyl transferase group 1  31.4 
 
 
389 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355509  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2170  glycosyl transferase, group 1  32.95 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0477227 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.07 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.07 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2429  glycosyl transferase, group 1  34.21 
 
 
366 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.183599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3447  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 
369 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3229  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453901  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0017  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.689138  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4958  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
822 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0651584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 
386 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2650  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
346 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.27 
 
 
775 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56030  hypothetical protein  25.17 
 
 
371 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0770  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
377 aa  50.4  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.6 
 
 
374 aa  50.4  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1934  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
408 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  26.35 
 
 
371 aa  50.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  25.81 
 
 
353 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  28.16 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
1261 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2374  glycosyl transferase group 1  24.31 
 
 
373 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00997519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
445 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  30.84 
 
 
374 aa  49.7  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  33.92 
 
 
381 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
374 aa  49.7  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0773  glycosyl transferase group 1  23.78 
 
 
457 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
360 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2416  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
391 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0844793  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  23.46 
 
 
372 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  30.84 
 
 
374 aa  49.7  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  30.84 
 
 
374 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  25.46 
 
 
388 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  30.84 
 
 
374 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  30.84 
 
 
374 aa  49.3  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1772  group 1 glycosyl transferase  24.62 
 
 
392 aa  49.3  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.680527  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
363 aa  49.3  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
369 aa  49.3  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  29.63 
 
 
374 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8230  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 
414 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3261  glycosyl transferase group 1  27.33 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  29.63 
 
 
374 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  29.63 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  29.63 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2873  group 1 glycosyl transferase  25.6 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  29.13 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11690  glycogen synthase  25.36 
 
 
398 aa  48.9  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.328537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  29.63 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
381 aa  48.9  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2081  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  29.63 
 
 
374 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  22.45 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  21.74 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
387 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4878  hypothetical protein  23.81 
 
 
371 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>