More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4067 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4067  glycosyl transferase  100 
 
 
1076 aa  2245    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0325707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
1250 aa  110  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.62 
 
 
312 aa  100  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
581 aa  97.8  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
325 aa  97.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
249 aa  95.9  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 
597 aa  94  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
321 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
299 aa  92.8  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
302 aa  92.8  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
330 aa  92.4  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
333 aa  91.3  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.12 
 
 
341 aa  91.3  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
310 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
352 aa  90.9  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 
305 aa  90.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
847 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 
303 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  35.11 
 
 
392 aa  89.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 
244 aa  89.4  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
327 aa  89.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 
250 aa  89  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
363 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
235 aa  87.8  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
318 aa  87  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
309 aa  87  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
398 aa  87  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 
347 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 
880 aa  86.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.24 
 
 
321 aa  86.3  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.5 
 
 
295 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
1032 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  26.44 
 
 
672 aa  85.5  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
373 aa  85.5  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.11 
 
 
317 aa  85.1  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.25 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
663 aa  84  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
727 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
318 aa  84  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
249 aa  84  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
277 aa  84  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.44 
 
 
266 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
337 aa  83.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
376 aa  83.2  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  30.65 
 
 
303 aa  82.8  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2455  putative glycosyl transferase  30.65 
 
 
303 aa  82.8  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0151212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  32.93 
 
 
384 aa  82.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  30.65 
 
 
303 aa  82.4  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2341  putative glycosyl transferase  30.58 
 
 
280 aa  82.4  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  normal  0.569311 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 
347 aa  82  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2240  putative glycosyl transferase  31.09 
 
 
280 aa  82  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
292 aa  82  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  33.49 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  30.81 
 
 
249 aa  81.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
274 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
294 aa  81.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.51 
 
 
340 aa  80.9  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  42.48 
 
 
372 aa  80.9  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  35 
 
 
266 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  35 
 
 
266 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
1301 aa  80.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  35 
 
 
266 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
374 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  35 
 
 
266 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 
1038 aa  79.7  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
1177 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 
1177 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01965  predicted glycosyl transferase  30.99 
 
 
279 aa  79.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1598  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
279 aa  79.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.59 
 
 
312 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1003  putative glycosyl transferase  30.99 
 
 
279 aa  79  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 
280 aa  79  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01954  hypothetical protein  30.99 
 
 
279 aa  79.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  33.33 
 
 
326 aa  79.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1144  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
209 aa  79  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1582  putative glycosyl transferase  30.99 
 
 
279 aa  79  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.18 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  34.26 
 
 
326 aa  78.2  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2352  putative glycosyl transferase  30.58 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
311 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2994  putative glycosyl transferase  30.58 
 
 
279 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00854526 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 
326 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
351 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  27.8 
 
 
309 aa  77.8  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
321 aa  77  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1541  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
304 aa  76.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>