43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0986 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0986  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  714    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.28 
 
 		 2401 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5335  hypothetical protein  31.34 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 1177 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3298  hypothetical protein  31.72 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0661206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 1759 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  30.35 
 
 		 1165 aa  70.1  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  30.35 
 
 		 1165 aa  70.1  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 1213 aa  67.4  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 1359 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5347  hypothetical protein  30.04 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1171 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 		 1190 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  27.61 
 
 		 1121 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 1192 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 		 1301 aa  60.1  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 1187 aa  59.7  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  26.97 
 
 		 1198 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.92 
 
 		 1191 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 1188 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 1193 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 		 953 aa  53.1  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3909  hypothetical protein  30.17 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2338  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 359 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1444 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1502  hypothetical protein  27.15 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 1162 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2590  glycosyltransferase  22.83 
 
 		 331 aa  47.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0360925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2522  glycosyltransferase  25.73 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30020  Glycosyl transferase, group 1 family protein  29.3 
 
 		 361 aa  47  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.349292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0618  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.36 
 
 		 366 aa  47  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 1476 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1367  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 		 1301 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.833598  normal  0.936092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3220  glycosyl transferase, group 1  25.95 
 
 		 673 aa  46.2  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  29.46 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1347  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.963322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5354  hypothetical protein  28.22 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1373  glycosyl transferase group 1  27.15 
 
 		 1303 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.13365  hitchhiker  0.0000853282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 		 1317 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2859  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1281  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 		 1292 aa  43.9  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0318394  normal  0.169433 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1367  glycosyltransferase-like protein  22.07 
 
 		 1608 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0176996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3711  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 371 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.102739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>